RNA

Accession Number TCMCG016R22618
RNA Id AWWV01013382.1_mrna_22618
Length 6081bp
Locus_tag CCACVL1_23211
db_xref InterPro:IPR010285
Organism Corchorus capsularis
Molecule_type mRNA
Product DNA helicase PIF1, ATP-dependent
Location complement(join(550..1446,3170..3320,3412..3569,3660..3792,3882..3963,4086..4210,4529..4767,4861..4964,5304..6515,6614..7484,7565..8088,8191..8766,8899..9317,9466..9571,9664..9699,9802..9918,10151..10481))

Sequence:
ATGAATCAGATGAACCAAAGAATGATTCATAGAATGTCACCTGGTGTGGTTTCGGAGGATACTTTGGATTTAAGTGATAGTAGTCATTGTATGAACGATGCCAGTGACGGCGATGTGTGCGAAAGAATCAAGAGAACTGAGATGCAATGTACAGCTGAAGTGATTGAAGACTTTGGAAAATTTCCTGTTCATAGTCGTCAACTGCATTTGGTAGGGGAATGCTCAAAATCCATGGTTGATGTTGCTTCGAAGCCGCAAACCAATTTAGTTATTGATGATAATGCCCGTTGTTCTGCTATAGTTTCTTTTGGAGCTGTTGCATTGTCCGTAGGAGAATCTTCAAATGCAATGATCAATATTTGTGCTGAGATGGGGATGCAGTCATTTGCTGATAGTCGTGTTCCTCCTCAATATTTGGATGAGTCTGTGGATCTTTCTAATTGCATAGATTGTCGAATTGATAATAGGATTGTGGAGCATAAAAGAACTATTTTTGAAGCCCTTAATTTTGGTGGCCCTTCCTATCAATGCTCTTCTTGCGGAGCTTACATGTGGTACGAGGAGAGAACTATTATATCTCGGAACACAAGTTTTCGGTTTACATCAATGGGTGCAAAGGTGGATGCTTCTGTAAACAGGGGTAGAGGTCCATTCATATTCAGGGTAAATGGCAGAAACTACCATCTGATCAGTTCATTGTTGCCACTCGAAGGTCAGCGTCCAAAGTTTGCTCAAATGTATATGTATGATGGTGATGAAGAGATCAATCATCGCCTGTCAGTTTTTGAGCAGCCAGGTCAGATGTCAGCGCTTGAAAGAGGAATAATTGAGGGCTTGACTGACATGTTAAATGCATGCAATGCTGTCGTTCAGTCTTTCAGATATGCAAGGGATATGATCAGACAACAGCCGCAGGAAAATTTCAATTTGAGATTGGTTGGTCAGCGTGATACTTCACTCCATAATTATACACCACCATCGGTTTCAGAAATAGCTGCTCTTATTCCAGATAATTTTCATCTAAATATTCCATTGTTTCAGTCCTCAATAGCTCCAAGAGTAACCCGTAAATGCATTACTATGCGTGATTATTATGCGTATCTTCTCCAACAGAGGGCATTAGAATCTAATACATTACTTAGAGGAGGTAGACTTTTCCAACAATTTGTGGTTGATGTTTACACTATGATTAAAGAAACCAGATTGAGATATATACGAGACAATCAAGCTGCTCTTAGATGTGATATGTACGAAAATGTTCGTGACGCAATTACAGAAGGTGATTTACGGGGTGACTCAGTAGGTTGTCGTGTTATTCTACCAGCGAGTTTTGTGGCAGGTCCTAGATATCTATTTCAGAATTATCAGGATGCTCTGGCCATATGTAGGCAATATGGGTACCCCTCTTTGTTTATCACTTTTACTTGCAATCCACGTTGGCCAGAGATTTTTGAGGCACTAAATATGATTCCTGGACAGCATCCTGAGGATAGACCGGATATTGTTGTTCGAGTTTTCCGTTTGAAGCTGAGAATGTTGATGAATGATCTGGTAAAGAATGAGTATTTTGGCAGAACTATTGCATCTCTTTATACAGTGGAATTTCAGAAACGGGGTCTTCCACACGCACATATCTTATTATGGTTAGATACAAGCTGGAGTCTTATCACTACACAATTTATTGATAAATATATTTCGGCTGAGTTACCGGACAAAGAGAAAGACCCTGTTGGCTATAATGTTGTTGTGAATCATATGTTACATGGTCCATGTGGTTATGCAAATCCAAATAACTCATGCATGAAAGATGGAATATGCAGTAAGGATTATCCAAAGGAATTTGTTCCTTATACTACTATGGACGAGGATGGCTTCCCTGTTTATAGAAGAAGGGAAGGAATAAATACTGCGAAAGTGAATGGTGTGGAGCTTGATAGCCGATCTGTTGTTCCTCATAATCTTGACCTTTGTGTCAAGTATCAAGCTCATATTAATGTTGAAGTTTGCAGCAGGACACAAGTAATTAAATATTTGTTTAAATACTTAAATAAAGGATTTGATCGAAGTAATGTAGTTTTGGAATCAGATAATGCTGATGGTCATAATGAGGGATCCTTCGGTGCAGAGGTTGTCGATTCATTTACCAAACCGGCAGCATGTTTTTTCCATGATTCACAACCACTACAGATGGTTCTTGAGAGAGAAGATGTGCAAGAAACTATGTTTACTCAATGGATGGCTATCAATAAGGTTGATCAGCGTGCAAGAACCTTGCTTTATTCTGAATTTCCAACTCATTATACTTGGATTGCCAAGGAAAAACGATGGAGGGAGAGGAGACAGGGAAGATCTATTGGTAGGATTATGTACATTCCACCAGTAGCTGGGGAAGTTTATTATATGAGGCTACTGTTGAACATTGTCAGAGGGGCTAGATGTTTTGAAGATATAAGAACAGTTGAAGGGGTTGTCTACACTACTTTTAAAGAAGCATGCACAGCTCATGGATTTTTGGGCGATGACAAGGGATGGATTGTAGCTTTGAATGAAGCTGTAGAGTCTGCAACAGGGCATCAAATGAGACGCTTATTTTTCACTCTAATAACCTATGGTCAGATTGTTGACAAAGTTGCATTCTTTGAAAAAAATTGGAAACTGCTCTCAGAAGATATCAGATATAATTTACAACGAGGAATGCGTTTGAAAAACTATACCATCCGTGACACAGATGTGCGAGGTTATGCTTTAGCTTCTCTCCAAGAAATATTTAGAAAAGAAGCTTCATCTCTTGAAGAGCACGGATTGCCACTTCCTGAATCTTCGATTGTCCATCATTTATCAAACCGGCTGATGAGAGAGGAACTTGATCATGATTATAATGCATTGCGGATGGAGCATTCGGAGAATTGTAGAAAATTAAATACTAGACAAGCTGAAGTGTATGGTATCATCAGGCAAGCAGCAGATGCTGGCGAAGGAGTGGCATCATCTGGAATTGCTTCTCAGTTACTGCCTGGAGGTCGAACTGCGCATTCTCGGTTCAGGCTTCCTCTACGTGTTGATGAAAGTTCCACATGCAAAATCTTTAAAAGAACTGAGTTAGCCTCTCTTATACAAGCAACGAGTCTGATAATATGGGATGAAGCACCAATGATTCATAGAAACTGCTTAGAAGCTTTGGACAAAACATTGCGAGATGTCATGTCTGATATTGCAAGCGATGCAACTCATAAGCCTTTTGGAGGGAAGACTATTGTGCTTGGAGGCGATTTTAGGCAGATTTTACCGGTTGTGCCAAGTGGAAGCAAGTCTCATATTATTGATGCTTCAATATGCAATTCCAGTCTATGGTCATATTGCAAAATTCTCAGATTGGAACAGAATATGAGGTTGCAGAGAACTAATTTAGATGAGGCTGAAAAAACTGAGATGGAATCATTTGGAAAATGGGTCCTCAGTATTGGTGATGGAACAGTTATGCGTGCTACGGCTGATTCTGATCTTGGTGCATCTACAGTCATCATACCAGATAGATTTCTGATACATACTGATGGGGATCCTATTCATGCTATTGTGAACACAATATATGCATCTTTTGAGGAGAATTACACTGATGCTATGTATTTGTCACAGAGAGCTATTGTGACTGCACATAATGATACTGTTGATGAGATCAATGATGTTGTGCTCAGCAAGATTTTAACTGAGGAGAGAACTTATTACAGTTCAGATTTTGTTTCAAAGACCAGTGGAAATATACAAGATCCGAATGCTCTTTACCCAACAGAATTGCTCAATAAGCTAACATTTCCTGGGATTGCTACACATATCCTAAGAATCAAAGTTGGTTGCATAATTATGCTTTTGAGAAACATAAGTCAGAGCGAGGGATTATGTAATGGAACTAGGTTGATTATCAAGACTATGAATAATAATGTAATAGAGGCAACTGTGTTGTCAGGACCAACACAAGGTCAAATAGTTTACATACCAAGAATAATGATGACTATTGAAGATAAGAAGCTTCCTTTTGTTTTGAATAGGAAGCAGTTTCCTATCAGACTGGCATATGCAATGATAATCAACAAAAGTCAAAGGCAGACCCTTGATTTAATAGGAATCTATTTGCCAAAGCCTGTATTTTCTCATGGTCAACTTTATGTGGCCGTATCAAGGGTAACTTTTCCAAGAGGTCAAAATCAGACCATCAAGCTTCGCATAACCCGTATGTGGGAAGTTTTCATCCCAACAACTCAGAAAAATCTTGGGATAGCTTTTCTTGCTGCTGATAATAGAGGGGAAGGAATTCATGTTCATGTTCCAGAAGCTAATGCACAGAAGTTTCGTCCAATGCTTATAGAGGGGATGTTGTATCACGTCTCGCGATTTCAAGTTGTAACTCCATATATGACTCATTTGACTGTTATAAGAAACTTTGGAATACTATTTAATAGAAATACAGTGCTTAAGCCTATTCCTGAAGATCCTGCTGCATACCCTAGACATTTCTTCCATTTTGATGATGATGACAAATTTGGAGATGAGATGAAGATCACTGTCTGGGAAGGCTGTTTTAATCAGATGGATGATGAACGTCTTCTAGCTTTGAATCCACCACCCATCATGATTTTTGCAGCAGTCAGTGTGCGAACTTTCAGAGATACTATTTATCTTCAGACAACTTCTGCTACAAAAATATATGCCAATCTTGATATTCCTGAGGTTGCTCCCATTAAAGCTAGGTTTGAAGGAGAGATGCACCAAGCTCAGTTTCAGCAATCTCAGAATCCACCGATGGACATTGTTGACGATCATTCCACACCACCTACAACAACAATAGCAGAGCTTTTGAGTTTTGAACCACAAAAGATTAAGCGCACTGTTTTCAAGACCACCGTTATTGTAGATGAGCTGAATCTCAACAATGGTTGGTTCTATAAAGCGTGCAACCTATGCAACAAAAAAGTCAATGAGCCAGAAGGGAATCCTATAAATTGCACATATCATGGTGAGAAGATTATACCTCGAATCAAGATGAGATTGCCAATTAGAATCAGTGATGAAACTGCTGGTATGGACATCACTCTTTTTGATAAAGAAGCAGAACAAATAACCAACACTTTCATCACCAGTCTATTGCAAATGGAGGTGTATCAGAGGAAAAAGTTCCAGATGGTGGTCTTGGATGTCAGAGAAAGTGAGTTGAAAGATATATGGAAATTATCAGAACCGATCCAAGATCTCATCCAAAGCTTAGAAAATATTTTTGATCTAAGCTACCCTACAGCTGTTCCAAAATACGTGCTGCAATCAAGAAAGAAGCCTATACTAGCAACCATAGCCAAGATTGTCATTGGTTATTTCTATCTAACCTGCGATGAACAGGACAAGACTGACAAGACAATTTTCAAATGGCTCAAAATTACTGACGCAGATATTCCATCTTCTGCAACAATTGCTCTCCAACTGCAGCAACCCAATATAATCCATGCATTGGCCACTCTAGGACTAGCAACCAATCCTTTTCCCATATTTACTTTCAAAACAAAATGCCCTGCACCAAGAGATCTAACATTTTCAAATCCTGTTCACCATTTTGGAGGCCAAGCAAATGAAAAAGCTTCTTTCCTAATCACTGCTCCTGATATTGTACAAGCAAACATTAGGATAAAGATGAAGCTATGCATGCTATCTGGGCAAACTTCATACGAATTAGACTTTAACTTCGGGAGAATGGGTTTATTCTCTGGAGTAGAAAGTGCAAGTCGCCCGTATAATGAGCCATTAGATCTACCTATGGTCCTGTATAATGCAAGAGGAGCTGACATCTCAGGATTTAAAATCCACCTGAAGAATATTGTCGAGACATATATCCCTATGATCATCATAATTACTGAAACACGACAAGGATCAGCAGAAGCAAAAGAGTATGGAGCATCTCTTGGTTATGAACAGGTGATATCTTCAAAACCTGTAGAGTGCAAGGGAGGAATTTGGATTCTCTCGAACCAGCAACATGTATCCATTCAACAACTCATGAACACTACTGAAGAAGTTCAAATCAATTTACTACGAGTCTAA